Plangintza eta Harreman Instituzionalen Zerbitzuak (SEPRI) zeregin nagusia du Zerga Agentziaren plangintza estrategikoa eta operatiboa diseinatu eta garatzeko, eta plangintza-tresna guztiak bultzatu, koordinatu eta jarraitzeko lanak bere gain hartzen ditu, erakundearen eginkizuna betetzera bideratutako zeharkako lanetan erreferentziazko zerbitzua izateko azken helburuarekin.

Era berean, bere gain hartzen du Zerga Administrazioko Estatu Agentziaren organo zentralen eta lurralde-organoen koordinazioa hainbat arlori eragiten dieten proiektuetan, eta bere gain hartzen ditu antolaketa zentrala eta lurralde-antolamendua koordinatzeko eta diseinatzeko lanak.

Era berean, nabarmentzekoa da zerga-administrazio autonomikoekiko harremanak koordinatzeko eta garatzeko egin duen lana. Horrela, Tributuen Kudeaketa Zuzendu eta Koordinatzeko Kontseilu Nagusiaren Idazkaritza Tekniko Iraunkorra betetzen du. Kide anitzeko organo hori Estatuko Zerga Administrazioaren, araubide erkideko autonomia-erkidegoen eta autonomia-estatutua duten hirien ordezkariek osatzen dute, eta lagatako zergen kudeaketa koordinatzeaz arduratzen da (adibidez, Ondarearen gaineko Zerga, Oinordetzen eta Dohaintzen gaineko Zerga edo Ondare Eskualdaketen eta Egintza Juridiko Dokumentatuen gaineko Zerga).

Horrekin batera, SEPRIk zeregin aktiboa du zergen arloan foru-administrazioen eta Estatuko Administrazio Orokorraren artean sor daitezkeen zerga-gatazkak aztertu eta horien jarraipena egiteko. Beste administrazio, erakunde eta entitate batzuekiko harremana koordinatzea ere bere eginkizunetako bat da, batez ere lankidetza sozialaren, informazioa emateko hitzarmenen edo elkar ulertzeko akordioen bidez egituratzen dena.

Kooperatiba-harremana, borondatezko betetzea sustatzeko tresna gisa, hainbat ekimenen bidez garatzen da, hala nola Enpresa Handien Foroa, Zerga arloko Profesionalen Elkarteen eta Elkargoen Foroa eta Langile Autonomoen eta ETEen Federazio eta Elkarteen Foroak. Foro horiek osoko bilkurak eta hainbat lantalderen bilerak egiten dituzte, eta SEPRIk koordinatzen ditu.

Bestalde, Agentziaren egoitza elektronikoaren edukien kudeaketa eta koordinazioa bere gain hartzen ditu, eta bere gain hartzen du beharrizan eta aldaketa teknologiko berrietara egokitzeko erronka. Era berean, honako eginkizun hauek ere hartzen ditu bere gain: hezkuntza zibiko-tributarioa sustatzea, horren sustapena funtsezkoa baita; administrazio elektronikoa, hainbat forotan parte hartuta; informazio-eskaeren erantzunen koordinazioa, Gardentasun Legearen esparruan, eta, oro har, harreman instituzionalak; Zuzendaritza Nagusiak agintzen dizkion beste eginkizun batzuez gain.

Azkenik, Plangintzako eta Erakunde Harremanetarako Zerbitzuak zeregin garrantzitsua betetzen du zergadunari aurrez aurrekoa ez den asistentzia-eredu berri baten garapenaren koordinazioan. Izan ere, eredu berri hori gauzatu da, alde batetik, laguntza digitaleko tresnak eta Zerga Agentziaren egoitza elektronikoan eskuragarri dauden gainerako informazio-zerbitzuak garatzean, eta, bestetik, Laguntza Digital Integraleko Administrazioak (ADI) sortzean, zeinak zerbitzuak ematen baitituzte hainbat funtzio-arlori dagozkien gaiei dagokienez, eta Diru-bilketako Telefono bidezko Arreta Zentroaren (REC@T) bidez zerbitzu ez-presentzialak ematea bultzatzean. Aurrez aurrekoak ez diren informazio- eta laguntza-funtzioen koordinazio hori Plangintzako eta Erakunde Harremanetarako Zerbitzuko laguntza digitaleko koordinazio-unitate batean eta laguntza-funtzioak dituzten sail guztiak ordezkatuta dituen batzorde iraunkor batean gauzatzen da, zerbitzu ez-presentzialak emateko eredu homogeneo eta eremu anitzerantz aurrera egiteko helburuarekin.

SEPRIk dituen koordinazio-, garapen- eta sustapen-funtzio horien multzoak, ezin bestela izan, Zerga Agentzia bideratzen du Estatuko erreferentziazko erakunde publikoa izateko eginkizunean, bere efikaziagatik eta efizientziagatik, zerga-sistema ekitatez betetzea sustatu eta ziurtatuko duena, Espainiako gizartearen garapena bultzatuz.